A primeira denominação da localidade foi Cabeceira, após alguns anos passou a ser chamada de Taquari em referência à nascente do Rio Taquari, que fica muito próxima à sede municipal. 
Povos indígenas, antigos habitantes da área, usavam a haste da taquara, abundante na região do Rio Taquari, para fabricar cachimbos e flechas. A denominação Alto Taquari foi escolhida através da Associação de Amigos, depois de ampla discussão com os moradores da cidade. Cogitou-se também, a possibilidade do nome da cidade ser São José do Taquari, em homenagem ao santo padroeiro São José, e ao Rio Taquari. 
A cabeceira do Ribeirão Furnas, tributário do Rio Taquari, que contribui para a Bacia do Prata, é o ponto mais meridional de Mato Grosso. 
Em 07 de maio de 1938, foi criado o Distrito Policial de Alto Taquari, e o Distrito de Paz em 17 de outubro de 1958. No dia 13 de maio de 1986, pela Lei nº 4.993, foi criado o município de Alto Taquari. 

English – HISTORY 

The first name of the town was Night, after a few years came to be called Taquari in reference to the source of the River Taquari, which is very close to the municipal headquarters. 
Indigenous peoples, ancient inhabitants of the area, used the stem of bamboo, abundant in the Rio Taquari to manufacture pipes and arrows. The term Upper Rio was chosen by the Association of Friends, after extensive discussion with the residents of the city. He thought also, the possibility of the city name to St. Joseph Taquari, in honor of the patron saint San Jose, and the Rio Taquari. 
The head of Ribeirão Furnas, tributary of the Rio Taquari, which contributes to the La Plata Basin is the southernmost point of Mato Grosso. 
On 07 May 1938, was created Police District of Upper Rio, and the District of Peace on October 17, 1958. On May 13, 1986, by Law No. 4993, was created the city of Upper Rio. 

Español – HISTORIA 

El primer nombre de la ciudad era de noche, después de unos años vino a ser llamado Taquari en referencia a la fuente del río Tacuarí, que está muy cerca de la sede municipal. 
Los pueblos indígenas, los antiguos habitantes de la zona, utiliza el tallo de bambú, abundante en el Taquari Río para la fabricación de tubos y flechas. El término Alto Río fue elegido por la Asociación de Amigos, tras un amplio debate con los residentes de la ciudad. Pensaba también, la posibilidad de que el nombre de la ciudad de San José Taquari, en honor del santo patrono San José, y el Taquari Río. 
El jefe de Ribeirão Furnas, afluente del río Tacuarí, que contribuye a la Cuenca del Plata es el punto más al sur de Mato Grosso. 
El 07 de mayo de 1938 se creó la Policía del Distrito del Alto Río de Janeiro, y el Distrito de la Paz en octubre 17, 1958. En mayo 13 de 1986, por la Ley N º 4993, se creó la ciudad del Alto Río.

Français – HISTOIRE 

Son nom de baptême Cabeceira (‘chevet’ en portugais) se fait très vite remplacé dans le langage populaire par Alto Taquari, fleuve qui nait vraiment très près de la ville. Le Cabeceira do Ribeirão Furnas, affluent du Rio Taquari et qui contribuent à la formation du Bassin de Prata, est le point le plus méridional du Mato Grosso. Le peuple indigène, premiers habitants de ce site, connaissaient parfaitement les propriétés de cette région. Ils utilisaient les hampes de taquara, bois que l’on trouve en abondance à proximité de Rio Taquari, pour fabriquer des flèches et des pipes. Ce changement de nom s’est effectué à l’initiative d’une Association d’Amis et après plusieurs entretiens avec les habitants. La proposition de São José de Taquari fut proposé en hommage au Saint José mais après plusieurs débats elle fut rejetée. 
L’emplacement privilégié de Alto Taquari, à la fois voisin de Goias et de Mato Grosso do Sul, lui a permis de se développer et de devenir au fil du temps le município trait d’union entre le Mato Grosso et ces deux autres Etats. Ainsi, la ville a toujours été le carrefour des colporteurs, bouviers et éleveurs, notamment avec la multiplications des échanges avec le município voisin Mineros. De 1960 à 1980, les transferts de bovins venus de Paranatinga, Pedra Preta, Barra do Garças et Rondonópolis pour se diriger vers l’intérieur de São Paulo ont été intenses à l’intérieur même de ce município. 
Aujourd’hui Alto Taquari est une plaque tournante de l’exportation du Mato Grosso vers Santos. C’est dans ce muncípio stratégique que va être reparti le soja, son de soja et autres denrées alimentaires par voie ferroviaire ou par voie routière. 
Le 7 mai 1938 fut crée le District de Police de Alto Taquari et celui de Paix le 17 octobre 1958. La loi n° 4.993 du 13 mai 1986 proclame Alto Taquari de município.